一篇24分的lncRNA研究是干什么的？

3. GClnc1的作用必要学术研究

为了探究GClnc1促进前列腺癌的必要，著者用于了RNA pull-down样本分析来鉴定细胞质内GClnc1建构遗传物质（Fig-4A）。 GClnc1后边样本出处两个特定的纯色。著者鉴定了94和101种潜在的建构蛋白（Fig-4B）。Western马尔季尼夫卡看出仅WDR5和KAT2A特异病态建构GClnc1（Fig-4C）。样本证明这两种核酸也许过渡到核酸以与GClnc1作用力。

每一次，著者挖掘出GClnc1的5'片段在非常进一步的pull-down校准之前与WDR5和KAT2A过渡到作用力（Fig-4D）。RIP得出GClnc1单独建构前列腺癌细胞质之前的WDR5和KAT2A（Fig-4E）。与IgG折衷远比，著者在抑制WDR5和抑制KAT2A免疫沉淀物之前侦测到GClnc1的平均5.5倍和4倍富集（Fig-4F 4G）。此外，著者观察到WDR5和KAT2A在前列腺癌细胞质之前作用力（Fig-4H）。掰除GClnc1或RNase处理除去了WDR5和KAT2A之间的作用力（Fig-4I）。因此，GClnc1对WDR5和KAT2A核酸作用力很极其重要。

每一次，著者在BGC823细胞质之前顺利完成了WDR5和KAT2A的ChIP-seq以确认GClnc1如何通气WDR5和KAT2A。 GClnc1 shRNA的转染证明两种酪氨酸通气剂的建构区域之前WDR5和KAT2A集之前于率减少（Fig-5A 5B）。非常进一步的样本分析证明，近20％的KAT2A集之前于DNA（147个DNA）也被WDR5集之前于，看出出不同寻常的交叠（Fig-5C）。每一次，著者用于RNA-seq鉴定了所致GClnc1通气的具有较高传达的DNA标示出，。重新组合ChIP-seq和RNA-seq样本，著者获得了平均120个DNA。大部份所致WDR5 / KATA2核酸通气的DNA之前被GClnc1的掰较高所除去（Fig-5D）。当GClnc1调升时，紧密结合的GSEA证明被抑制的DNA不同寻常富集（Fig-5E）。因此，掰除GClnc1会损伤WDR5和KAT2A核酸的过渡到。

这些样本证明GClnc1可以作为该核酸的栓，从而控制其通气酪氨酸修饰，DNA传达和生物活病态的灵活性。

基于ChIP-seq和RNA-seq样本，SOD2是WDR5 / KAT2A核酸的靶DNA之一。著者挖掘出SOD2和GClnc1传达之间的方面病态最强（Fig-6A）。在组群1之前的165个前列腺癌之前也挖掘出了SOD2和GClnc1之间的正方面病态（Fig-6B）。并且GClnc1的DNA片段与SOD2DNA的外清高子和外显子的一部分交叠（Fig-6C）。同步PCR和Western马尔季尼夫卡样本看出，当转染两种不同的GClnc1 siRNA时，SOD2传达不同寻常减少（Fig-6D）。荧光素酶校准看出GClnc1的掰较高损伤了SOD2操纵子的调控水平（Fig-6E）。 SOD2传达的掰减不同寻常减少了由GClnc1游离的前列腺癌细胞质的转化（Fig-6F）。 SOD2的调升也不同寻常阻断了GClnc1游离的细胞质侵扰（Fig-6G）。因此，SOD2诱导GClnc1在前列腺癌细胞质之前的通气功用。

RT-PCR看出WDR5或KAT2A的掰较高不同寻常阻断了GClnc1游离的SOD2调升（Fig-7A）。 ChIP校准证明WDR5和KAT2A单独建构SOD2的操纵子区域（Fig-7B）。掰除WDR5，KAT2A和GClnc1不同寻常减少了它们与SOD2操纵子的建构高效率（Fig-7C）。比如说，WDR5和KAT2A是能够识别H3K4和H3K9的核酸。 H3K4底物和H3K9脯氨酸也可以通气SOD2的调控。著者在SOD2的相同操纵子区域挖掘出了H3K4三底物和H3K9脯氨酸（Fig-7D）。掰除GClnc1，WDR5和KAT2A减少了H3K9脯氨酸和H3K4底物水平（Fig-7E）。 ChIRP看出GClnc1单独建构SOD2操纵子区域（Fig-7F）。

根据以上样本，如Fig-7G所示，著者得出结论，GClnc1可作为栓lncRNA募集WDR5和KAT2A，介导SOD2的调控过程，增大前列腺癌细胞质的转化和转回，再度促进前列腺癌成效。

参考文献：

Tian-Tian Sun, Jie He, Qian Liang, Lin-Lin Ren, Ting-Ting Yan, Ta-Chung Yu, Jia-Yin Tang, Yu-Jie Bao, Ye Hu, Yanwei Lin, Danfeng Sun, Ying-Xuan Chen, Jie Hong, Haoyan Chen, Weiping Zou and Jing-Yuan Fang. LncRNA GClnc1 Promotes Gastric Carcinogenesis and May Act as a Modular Scaffold of WDR5 and KAT2A Complexes to Specify the Histone Modification Pattern. Cancer Dis. July 2016 IF=24.373 DOI: 10.1158/2159-8290.CD-15-0921

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